Поверхность территории слагается осадочными породами палеогена, неогена и четвертичного возраста. Эоценовые (P21+2) глины нижнего и среднего отделов обнажаются на склонах увалов котловины Денгизкуль. Эти глины выветрелые в виде сплошных масс имеют зеленого и темно-зеленого цветов. Верхний эоцен (P32-3) средний, верхний олигоцен представлены также глинами. Соленосная толща сложена в основном хлористым натрием. Минеральный состав озер: астраханит Na2S04 MgS04 4H2 – галит, эпсомит – Mg S04 7H2O, глауберит –. Na2 S04 CaS04., тенардит - Na2 S04, мирабилит – Na2 S04 10 H2O, сильвин. Минералообразующим и породообразующим являются астраханит и галит.
Бухарская область ,
Спессартит с прожилками кварца мощностью 2-3 мм. Порода слегка ожелезненная. В кварцевой жиле наблюдаются кристаллы рудных минералов (пирит и арсенопирит). Жила продолжает пересекать крупнозернистый гранит и тут уже в кристаллах пирита можно различить характерную им штриховатость и кубическую форму. Структура скрытокристаллическая, текстура массивная.
Среднезернистый лейкократовый ультракислый гранит
Наряду с чистыми тонкодисперсными глинами широко развиты глинистые породы со значительной примесью алевритовой и мелкозернистой песчаной фракций (до 45%). Обломки представлены полуокатанно-угловатыми зернами кварца, полевых шпатов, редко глауконита. Размер обломков 0,02-0,1мм. Распределение обломочного материала преимущественно равномерное, но отмечаются слои резко обогащенные им